Yksikään historiankirja ei kerro, kuinka fafnirit tarkalleen ottaen ilmestyivät maailmaan. On kuitenkin yleisesti ymmärretty, että heidän veriperimänsä on lähtöisin lohikäärmeiltä asti - tästä suurimpana todisteena pidetään taitoa hallita taikuutta.

Magia on energiaa, joka ympäröi kaikkea maailmassa. Fafnirien taito kontrolloida tätä energiaa vaihtelee - on huomattu, että toisissa suvuissa magian taito virtaa vahvempana kuin toisissa. On myös ymmärretty, että joskus vuosisatoja sitten fafnireiden magia oli paljon vahvempaa kuin nykyään. Nykyisin vain taitavimmat ja oppineimmat fafnirit kykenevät hallitsemaan useampaa loitsua. Heitä kutsutaan Maageiksi.

Maagiksi pääseminen vaatii vuosien koulutuksen kuninkaallisessa Akatemiassa. Pitkälläkään opiskelulla kuka tahansa ei kuitenkaan voi päästä Maagiksi, mikäli taikomisen taito on veren tai luonteenlujuuden vuoksi heikkoa. Maagien tärkeimpiä töitä on kerätä tietoa magiasta ja maailmasta yleensäkin, ja heidän tiedoillaan on täytetty jättimäisen Tähtitornin kirjastot ja arkistot aivan äärimmilleen.

Kaikki fafnirit omaavat ainakin jonkinlaisen magian taidon, joka kehittyy syntymästä lähtien. Hyvin yleisiä taikuuden ilmentymiä on taito hallita luonnon elementtejä; vettä, tulta, ilmaa, maata tai sähköenergiaa. Ei ole harvinaista törmätä fafniriin, joka kykenee elvyttämään kuolevia kasveja, rauhoittamaan eläimiä tai näkemään pimeässä. Taitoja on lukemattomia, mutta yleistä on jonkinlainen yhteys luontoon. Harvemmin myös näkee kouluttautumattomia fafnireita, jotka kykenevät taikomaan erityisen vahvoja loitsuja tai hyödyntämään magiaa monta kertaa päivässä väsymättä. Magia kuluttaa käyttäjänsä energiaa, ja senkin hallintaa on tärkeää harjoitella. Monet fafnirit hyödyntävät kuitenkin magiaa päivittäin, varsinkin mikäli siitä on hyötyä töissä ja arjessa yleisestikin.

Magian käyttö ei vaadi loitsusanoja tai mitään ulkopuolista esinettä, mutta jokaisen fafnirin tapa käyttää taitojaan on erilainen.